تم إنشاء برنامج الماجستير في الاتصالات اللاسلكية في جامعة اليرموك في عام 2002 وهو مصمم لتزويد الطلاب بالمعرفة والمهارات المتقدمة في مجال تكنولوجيا الاتصالات اللاسلكية. يركز البرنامج على الجوانب النظرية والعملية على حد سواء، مما يجهز الخريجين للعمل في الأوساط الأكاديمية والبحثية وصناعة الاتصالات.

يركز برنامج الماجستير في هندسة القوى الكهربائية على تصميم وتحليل وإدارة أنظمة الطاقة الكهربائية. يتضمن البرنامج على مساقات متقدمة في تحليل انظمة الطاقة، وإلكترونيات الطاقة، والآلات الكهربائية، وأنظمة التحكم الحديثة، والأدوات الهندسية المتقدمة المستخدمة في التحليل والاستنباط. يطلع الطالب في البرنامج على أنظمة الطاقة المتجددة المختلفة، وأنظمة الشبكات الذكية، وحماية أنظمة القوى الكهربائية، وتقنيات تخزين الطاقة المختلفة.

يعد برنامج الماجستير في الإدارة الهندسية متخصصا بتزويد المهندسين العاملين بالقدرات الإدارية اللازمة لتطوير ادائهم ويعد مختلفا عن باقي التخصصات الإدارية الاخرى. يمتاز البرامج بنوعية المواد المطروحة حيث يهتم بالتركيز على مواضيع حديثه لها صله بالصناعة والتقدم التكنولوجي والادارة الهندسية.

استحدث مؤخرا برنامج الماجستير في هندسة النظم والمعلوماتية الطبية الحيوية في كلية الحجاوي للهندسة التكنولوجية في جامعة اليرموك، ابتداءً من العام الدراسي 2023/2024. يهدف البرنامج إلى تخريج كفاءات على درجة عالية من التقدم المهني في مختلف مجالات الهندسة الطبية الحيوية، وخاصة القطاع الصناعي، والذين لديهم القدرة على إجراء البحث العلمي الدقيق وتحمل المسؤوليات المهنية والأخلاقية في مجال الهندسة الطبية الحيوية.

يوفر هذا البرنامج أساسًا قويًا في التصميم الهيكلي، وتقنيات البناء الحديثة، وإدارة المشاريع، وإعداد الخريجين للقيادة والابتكار في تشييد المباني والهياكل والبنية التحتية، إذ إنّ خريجي هذا البرنامج مستعدون بشكل استثنائي لسوق العمل في الأردن وخارجه، من خلال المنهج الذي يدمج المعرفة النظرية المتطورة مع الخبرة العملية، حيث يكون الطلبة مجهزين لمواجهة تحديات مشاريع البناء الحديثة، ويكتسبون مهارات مطلوبة بشدة، مثل حل المشكلات المتقدم، والإدارة الفعالة للمشاريع، والقدرة على دمج الاستدامة في ممارسات البناء.